隨著使用時間長，潔凈室的表面會變臟，應(yīng)該進行清潔。試想下，不對潔凈室的表面進行清潔，那么，當(dāng)產(chǎn)品接觸到臟的表面時，污染就會傳到產(chǎn)品上。人員接觸了潔凈室的表面后又接觸產(chǎn)品，又造成二次污染。表面看上去相當(dāng)潔凈的潔凈室，如按照潔凈室的要求來衡量，說不定很臟。因為比50微米小得多的粒子，人的肉眼是看不到的。潔凈室清潔是要定期進行。

生物潔凈室工作人員每分鐘能夠散發(fā)出幾百個乃至幾千個帶有細(xì)菌的粒子。這些微生物是由表皮細(xì)胞或表皮細(xì)胞的碎片所攜帶。其平均當(dāng)量直徑為10微米到20微米。如果不不進行清潔工作，這些粒子由于重力作用很容易降落在潔凈室內(nèi)的表面上，造成污染。在醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)中，對潔凈室應(yīng)該進行消毒以殺死微生物,，以達(dá)到相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)的潔凈度。